在常见鱼病中，往往有的症状相似，而病原体不同，必须加以区别，才能对症下药：
一、病毒性肠炎与细菌性肠炎。病鱼肠管均呈红色，但病毒引起的还兼有口腔、肌肉、鳃盖、鳍条等充血现象， 肠粘膜皮肤一般不腐烂脱落；而细菌性肠炎，没有口腔肌肉充血现象， 但肠道粘膜往往溃烂化浓，乳黄色的腹水很多。
二、具白点症状的鱼病。包括白皮病、打粉病(白鳞病)、 小瓜虫病及微孢子虫病。后两种的主要区别是，病鱼死后2～3小时，观察其发病部位， 仍有白点的是由微孢子虫引起的，没有则是小瓜虫引起的。 前两种病的区别：背鳍、尾鳍及背部先后出现白点，但随病情加剧，白点数目不断增多，最终白点遍及全身，使整个体表似擦了一层白色粉末，此是打粉病。 而白皮病白点只出现于背鳍基部或尾柄处，病情发展也只是白点本身的面积扩大， 最终表现为以背鳍至臀鳍为界的整个后部皮肤呈白色。寄生于体表的小瓜虫与打粉病白点的主要区别是：前者细看白点间有充血的红斑。
三、“鳃盖张开”状鱼病。包括车轮虫病和指坏虫病等。前者具有典型的“白头白嘴”，鳃丝鲜红等状；后者则鳃丝呈暗蓝色，鳃部明显浮肿。
四、“肠壁膨大”状鱼病。球虫病、许氏绦虫病、九江头槽绦虫病、刺棘虫病、新棘吻虫病及鲤棘吻虫病等， 不同程度的肠壁膨大或肠道堵塞等症状。 但侧殖吸虫病和九江头槽绦虫病分别有闭口不吃食和口常张开不吃食的明显症状与其它病相区别。球虫主要寄生于青鱼。许氏绦虫和鲤长棘吻虫均只寄生于鲤鱼，但后者一般是寄生于前肠，严重时肠管发炎、 肿胀和溃疡，肠壁穿孔。刺棘吻虫主要危害草鱼。
五、磷片隆起症状鱼病。包括鲤鳍子宫线虫病和竖磷病。 前者鳞片隆起的程度大，以至磷片竖起象松球状，磷的基部水肿呈半透明的小囊状，挤则出水。后者不具此症状。
六、“急躁不安”、“狂游”或“跳跃”现象的鱼病。包括疯狂病、 中华鳋病、鲺病、锚头鳋病及复口吸虫病。疯狂病和鲢中华鳋病均是危害鲢鳙鱼的。但前者病鱼有脊柱向背部弯曲，整个尾部极度上翘而露出水面， 呈波浪形旋转运动，一时沉入水底，一时露出水面等明显症状；而后者脊柱不弯、尾鳍仅上叶常露出水面(故又称翘尾巴病)， 病鱼仅在水体表面打转或狂游。大中华鳋与鲢中华鳋病的主要区别是，前者只寄生于草鱼、青鱼的鳃部，而后者只寄生于鲢、鳙鱼鳃部；前者病鱼有跳跃、不安现象， 后者病鱼和一般不跳跃。大中华翘鳋病与鲺病均有跳跃现象，但只要掀开鳃盖观察， 就可发现前者鳃丝末端挂有许多象白色的小蛆，因此人称“鳃蛆病”，后者鳃上没有这一现象。另外，锚头鳋病与复口吸虫病鱼也呈现急躁不安的现象， 复口吸虫病不仅表现为在水面不安地挣扎、还有头朝下，尾朝上的显著症状， 易于判断。 七、池边聚集周游或头撞岸边。这可能是跑马病、泛池或是由小三毛金藻引起的鱼类中毒，肖者仅是绕池周游，驱之难散， 而后两者一般发生在清晨，一般有头向岸边、静止不动的现象， 但泛池往往还有大部分鱼类狂游乱窜，或横卧水面，呈现奄奄一息状态。小三毛金藻中毒一般是鱼游四隅集中、驱之即散，有时还窜到岸上。
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