药物清塘是利用药物杀灭池中危害鱼、虾、蟹苗种的病原体、寄生虫和各种凶猛鱼、野杂鱼及其他敌害生物，避免因病害影响养殖品种正常生长发育，从而提高养殖效益。目前清塘药物品种较多，但不同品种药物作用不同。常用的清塘药物有生石灰、漂白粉、茶饼、氨水、巴豆、塘克宁等。
一、生石灰清塘 生石灰即氧化钙，其清塘作用是生石灰遇水后发生化学反应，产生氢氧化钙，并放出大量热能。氢氧化钙为强碱，其氢氧离子在短时间内能使池水的pH值提高到11以上。从而能迅速杀死野杂鱼，各种卵，水生昆虫，螺类，青苔，寄生虫和病原体及其孢子等。同时生石灰与水反应，变成碳酸钙，碳酸钙能使淤泥变成疏松的结构，改善底泥通气条件，加速底泥有机质分解，加上钙的置换作用，释放出被淤泥吸附的氮、磷、钾等营养素，使池水变肥，起到了间接施肥的作用。生石灰清塘方法有两种：分为干法清塘和带水清塘。
干法清塘：是先将池塘水放干或留水深5～10厘米，在塘底挖掘几个小坑，每亩用生石灰70～75千克，并视塘底污泥的多少而增减10%左右。把生石灰放入小坑或用水缸等乳化，不待冷却立即均匀遍洒全池，次日清晨最好用长柄泥耙耙动塘泥，充分发挥石灰的消毒作用，提高清塘效果。一般经过7～8天药力消失后，即可以放鱼。
带水清塘：对于清塘之前不能排水的池塘，可以进行带水清塘，每亩水深1米用生石灰125～150千克，通常将生石灰放入木桶或水缸中溶化后立即趁热全池均匀遍洒。7～10天后药力消失即可放鱼。实践证明，带水清塘比干法清塘防病效果好。带水清塘不必加注新水，避免了清塘后加水时又将病原体及敌害生物随水带入，缺点是成本高，生石灰用量比较大。
不论是带水清塘还是干法清塘，经这样的生石灰清塘后，数小时即可达到清塘效果，防病效果好，但必须注意的是，碱性较强的水体不能用此法清塘。
二、漂白粉清塘 漂白粉一般含有效氯30%左右，经水解产生次氯酸，次氯酸立即释放出新生态氧，它有强烈的杀菌和杀死敌害生物的作用。施用时先用木桶加水将药物溶解，立即全池均匀遍洒，泼完后再用船和竹竿在池中荡动，使药物在水体中均匀分布，以增加药效。每亩水深1米的池塘用13.5千克。4～5天后药力消失即可放鱼。漂白粉有很强的杀菌作用，但易挥发和潮解，使用时应先检测其有效含量，如含量不够，需适当增加用量。
三、氨水清塘 氨水是一种很好的液体氮肥，呈强碱性。高浓度的氨水能使池水的pH值发生显著变化，能杀灭野杂鱼类和起到杀菌灭虫的效果，有较好的防病作用。使用时一般将池水排干或留水深6～9厘米，每亩用氨水12～13千克，加适量水全池均匀遍洒，过4～5天即可加水放鱼。
四、茶粕清塘 茶粕，又称茶籽饼，呈紫褐色颗粒，是山茶科植物的果实榨油后剩下的渣滓。茶粕含有皂素，又称皂角甙，能杀死泥鳅等各种野杂鱼类、螺蛳、河蚌、蛙卵、蝌蚪和一部分水生昆虫。茶粕的蛋白质含量较高，是一种高效肥料，对淤泥少、底质贫瘠的池塘可起到增肥作用。使用茶饼清塘一般采用带水清塘，使用时先将茶粕捣碎，放在缸内浸泡，隔日取出，连渣带水泼入塘内即可，用量为每亩1米水深用40～45千克。由于皂素易溶于碱性水中，使用时每50千克茶粕加1.5千克食盐和1.5千克生石灰，药效更佳。
五、巴豆清塘 巴豆只能杀死大部分野杂鱼，而且毒性消失时间较前几种长。因此采用巴豆清塘消毒后需在10天左右才能放养鱼苗，并且在鱼苗下塘时，有必要试水检查池水的毒性。使用时先将巴豆带水打碎，然后浸泡3天，入塘时连渣带汁全池泼洒。其用量为平均水深1米，每亩用3～5千克。
六、塘克宁 塘克宁是采用特殊工艺处理浓缩而成的新型植物提取物，是一种绿色环保清塘剂。本品专杀鱼类、泥鳅、蝌蚪、螺蛳、钉螺等，可用于虾、蟹养殖过程中的清塘，且使用五倍剂量仍对虾、蟹安全。用于虾、蟹池塘清塘具有其它药物不可取代的功效。使用时将本品放入桶内，加50～100千克水充分搅匀后全池均匀泼洒。其用量为本品1千克可使用6亩15厘米水深，即每亩1米水深用1千克。由于本品易溶于碱性水中，使用时每1千克加3千克食盐和3千克生石灰混合后加水搅匀泼洒，效果更佳。本品单独用于灭螺时，使用剂量可减小，以节约成本。
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