鳜鱼是一种名贵的商品鱼，但易受微生物和寄生虫的侵袭，加上生物和人为的因素，由于发病导致鳜鱼大批死亡的事情时有发生。

细菌性烂鳃病。此病主要是由鱼害粘球菌引起。病鱼鳃丝腐烂发白，常附着污泥和沾液，严重时其鳃盖骨内表皮被腐蚀为一个似透明的小窗区域，病鱼离群独游，上浮于水面缓慢游动，体色渐变黑，头部乌黑。每年的4-9月为发病期，7-9月最为流行。
 
 治疗方法：①按每立方米水用1克漂白粉全池泼洒，间隔1天再用1次。②以每亩水深1米全池泼洒生石灰25公斤。③每立方米水用3克大黄氨水溶液全泼洒，连续2次。具体方法是：每公斤大黄用20公斤0.3％氨水浸12-24小时。药液呈棕红色后，药液和药渣用池水稀释全池泼洒，间隔2天再用1次。
 
 暴发性出血病。该病主要是在环境不良情况下由细菌感染引起，或由病毒感染，继由病菌扩大蔓延。病鱼鳃盖及各鳍条、体侧有不同程度的出血斑点，尤其反映在鳃瓣内充满血块和血沾液物。肝脏和胆囊肿大，肝表层深黄色或浅白色。
 
 治疗方法：由于病鱼食欲减退，甚至厌食，加上水体中、鱼的体表均有大量的病菌，故宜采用全池泼洒一种新药鱼血停（克暴灵）百分之零点二五或新药一元二氧化氯制剂百万分之零点七至百万分之一点二或应氏消毒剂百万分之零点七到百万分之一点四。这样内服外用3-4天，可获良好的治疗效果。此外，由于寄生性的车轮虫、蠕虫等带菌者，故先用 鱼虫克星 和 咪唑王 杀灭之，可收到事半功倍之效。 
 
 铺头鳋。是由锚头鳋寄生于鱼的鳃、皮肤、鳍、眼、口腔等引起的。用肉眼可看见虫体的前半部钻到寄生组织内，后半部露在外面，寄生部位周围组织红肿发炎，形成石榴子般的红斑。锚头鳋的头部钻入肌肉组织，可引起慢性增生性炎症。在伤口与外界相通的部分又带有溃疡的性质，极易引起感染。病鱼最初呈现不安，食欲减退，鱼体消瘦，严重时可引起死亡。治疗方法由于鳜鱼对晶体敌百虫敏感，可用百万分之零点一二五至百万分之零点一五强力杀虫精全池泼洒和用强氯精百万分之零点四全池泼洒，对鱼体的伤口进行消毒，免遭细菌感染。用此方法治疗颜色铁锚虫病效果较为理想。