选配即人们有目的有意识的确定公母犬的交配，以人为地组合后代犬性状的遗传基础，创造符合人类意愿的理想型藏獒个体的技术过程。在动物育种中，一向认为选配是选种的基础，选种又可以促进选配，二者互相促进，不可偏废，那种只重视选种而忽视选配的认识是错误的。藏獒的选配有三种技术方法；
1按性状组合进行选配；
这种交配方式适合于犬群组建时间不久，规模较小，犬只来源较复杂、类型较多的犬场，可根据与配公母犬的品质对比而决定与配犬。为此应选取在性状表现，性能特征，体质类型以及与适应性有关的性状上相同或不相同的个体进行交配。前者称为同质选配，后者称为异质选配。这两种选配方法有时单用，有时同用。即根据与配公母犬在体形外貌、体质、体尺（体高，体长，胸围，管围）、头型，嘴型，耳型，以及骨量和毛色等方面的表现，分别选取品质相同或不同的个体交配，有时可能先同质，后异质；也可能某几个性状上是同质，另外的性状上是异质。进行品质选配应有计划，计划应尽可能详细。如果是异质选配，公犬应在体尺、头型、嘴型、耳型和骨量上有优势，表现出类拔萃。母犬在体长、体高、繁殖力等方面有良好表现。这样的公母犬交配，后代一般会秉承父母双方的优点，形成后代犬优良的性状性能。
2按血统选配
按血统选配的含义是指以血统或家系为单元，在家系内或家系间开展有目的的选配，其意义在于保持并巩固场内各血统或家系的品质特征，保持不同的犬只类型，巩固遗传性。例如藏獒犬有三种毛型，并各自在头型、嘴型、体型、被毛分布、气质品位等方面具有特点。按血统选择公母犬交配，可以有效地将不同血统公母犬所具有的性状与特征集合在一起，创造出理想的藏獒个体，也可以把各血统犬只所具备的优良性能和特征稳定下来，保持下去。按血统选配的方法适用于具有系统选育的历史、对藏獒的选育有明确的目的与计划，犬只类型已逐渐分明，血统记录清晰的场家。
按血统选配方法与按家系留种的方法应科学结合使用，一方面按家系留种，规定在世代更替中，必须为每只优良的种公犬留有一个儿子，以继承其血统。也规定为每条母犬留一个女儿，以保持其遗传性。这样可使各家系的特征得以保存。另一方面，并不排除各血统间或血统内公母犬间的交配。就后者而言，容许有一定范围和程度的近交，以求使某一家系犬只独特的品质性能得到扩展或稳定遗传，或者剔除某一血统可能存在的隐性缺陷。后者最有效的方法就是在该家系犬只中实施一定程度的亲缘交配，即近交。据测定，藏獒犬有较强的抗近交能力，使用近交系数3.125％－12.5％的近交形式，诸如姑侄、叔侄、甚至半同胞等交配形式，将在后代犬中再现出类拔莘的祖先犬个体的形态和特征，而后代犬只在生活力、抗病力、适应性及生长发育等方面一般并不表现出衰退。进而言之，遍查世界所有家畜、家禽的育成历史，几乎都不同程度地使用了近交。近交可以促进性状基因的纯合，巩固性状的遗传性，揭露有害基因，并通过定向选择，而有效形成犬群的整齐一致。所以只要有明确的目标和正确的措施，灵活的方法，严格选种，就不仅能防止近交所可能引起的不良后果，做到近交不衰退，并可以尽快地建立性状稳定、品质纯正的藏獒犬群。理论上也可以说明，按血统选配能最有效地促优良基因的纯合，固定优良性状并保存某些优良个体的血统，使某一理想藏獒犬的品质性能尽快变成群体所共有，实现创造和培育优良藏獒犬的目标。
3按等级选配
即按《藏獒综合评定等级标准》对与配公母犬进行等级评定，确定公母犬的等级后，再确定公母犬的配对或交配。
通常公犬的评定等级应高于母犬，每世代主配公犬应达到特级，不低于一级。而基础母犬或与配母犬应达到一级，个别具备独特性能或特征的藏獒母犬容许二级。公犬的等级按特级或一级要求，原因在于公犬影响面大，“公犬好，好一坡”，选择品种性能或特征优良的藏獒公犬配种，利于提高犬群的整体水平，并使犬群性状整齐，表现一致。坚持等级选配，是全面推进藏獒系统选育，全面提高藏獒品质性能的必由之路。
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