抗虫棉有效控制了棉铃虫危害，蕾铃脱落数量大大减少，生殖生长旺盛，结铃早而多，需肥高峰来得快而猛。若按传统施肥方法，往往不能满足其需求，致使其营养生长不良而发生早衰。而钾肥有增强棉花抗逆性的功能和防病效果。因此抗虫棉需要增施钾肥。增施有机肥、钾肥，减少氮、磷肥：亩施有机肥3000公斤左右、钾肥10-15公斤。由传统的亩施尿素25-30公斤，减至亩施尿素12公斤。

改花铃肥一次集中施用为两次施用：花铃期是棉花一生中生长发育最旺盛、需肥最多的时期，需重施花铃肥。一般需亩施尿素25-30公斤、钾肥10公斤。针对抗虫棉开花结铃快而集中的特点，可将花铃肥的2/3施在初花期，剩余的1/3过15天左右再追施，这样能满足棉花不断开花结铃的需要。

改盖顶肥土壤追施为叶面追施：棉花生长后期，根系的吸收能力下降，若养分不足，极易引起早衰，需施盖顶肥。