棉花从播种到出苗50天内可发生多种病害，常导致烂种、烂芽、烂根、叶枯，严重时造成缺苗断垄，不能一播全苗，甚至毁种，对后期产量质量影响很大。按照其发病部位可分为两大类：一类是根病，主要包括立枯病、炭疽病、红腐病，常造成烂种、烂芽、根茎腐烂，造成整株、成片死苗；另一类是叶病类，主要包括黑斑病、角斑病等，危害叶片，造成叶片枯焦，影响幼苗早发。

棉花苗期（播种-出苗-现蕾）病害危害较重的主要有立枯病、炭疽病、红腐病。 

一、病症 

（一）立枯病  

半知菌亚门，真菌，立枯丝核菌属。

棉苗出土前即可发病，造成烂种、烂芽。出苗后发病的部位在茎基部，先在茎基部产生黄褐色病斑，病班逐渐扩展绕茎基部一周，缢缩，棉苗萎蔫倒折。  

（二）炭疽病  

半知菌亚门，真菌，炭疽病菌属。

棉苗出土前幼芽、幼根变褐色，腐烂。棉苗出土后，茎基部一侧先出现红褐色小斑点，后逐渐呈梭形凹陷病斑。病斑中央灰白色，边缘红褐色，严重时病斑连接包围茎基部造成死苗，病斑处红褐色。湿度大时，病斑上产生小粒点，表面有粉红色粉状物（孢子团）。此外，幼苗叶缘上可形成椭圆形病斑，后期在棉铃上也可发病（圆形凹陷斑）。  

（三）红腐病  

半知菌亚门，真菌，镰刀菌属。

发病部位为整个根部。棉苗出土前幼芽变褐腐烂，出土后整个根尖端呈褐色，水浸状，略肿胀，后腐烂死苗。病轻的可在根茎部长出新根，但苗弱。  

二、病害循环 

初侵染来源主要是带菌棉种、土壤及病残体。发病过程根据传播途径可分为两种类型，即土壤传播类型和种子传播类型。  

（一）土壤传播类型

以立枯病为主，其次为红腐病。立枯病菌是典型的土壤真菌，可以菌核和病残体上的菌丝在土壤中长期存活，以表层5-6cm土层分布较多。当条件适宜时，菌核萌发的菌丝在土壤中扩展，侵染，随着地温升高，棉苗生长抗病力增强，立枯病可停止发展。 

病原菌在土壤中扩散主要中耕、浇水、降雨，并可等引起多次再侵染。  

（二）种子传播类型  

以炭疽病、红腐病为主，其次是黑斑病。病原菌以分生孢子附着在种子表面的短绒上，以菌丝体潜伏在种子内部越冬，作为初侵染来源。当春季带菌种子播种后，萌发时，越冬菌即开始萌动生长进行初侵染。 　

田间发病后，病部产生的分生孢子靠空气、降雨等传播进行再侵染。降水主要使红腐病扩展（湿度大）而炭疽病和黑斑病的再侵染主要靠空气、降雨传播，尤其是雨滴反溅作用可使叶片上发病。空气传播甚至可大范围传播，并传播棉铃上，使种子带菌。  

三、发病条件  

棉花苗病的发生与气候条件、棉种质量及耕作栽培措施有较密切的关系。  

（一）气候条件  

各种苗病病原菌生长、繁殖和侵染需要较高湿度，因此苗期遇到阴雨及土壤湿度大时有利于病害发生和发展。（如播种时人工造墒的湿度大，发病较重）。