由于猪肺炎支原体的感染所造成的高流行率，防治地方性肺炎为养猪业界主要的课题。维持猪群的清洁显然是最好的方法，但却不容易实行。因此，必须利用管理、治疗及疫苗。
1、建立无地方性肺炎的种猪群：最佳的方法是建立一个新的猪场或先完全清群后再重建猪群，引进必须是“无特定病原猪”（SPF）仔猪，这方法效果最佳，但成本高，困难的是要维持猪肺炎支原体的清洁。若与感染猪场距离少于3公里，那么早晚猪场都会因空气传播而受到污染。另一个方法是部分清群，当地理环境合适时，在14天内只保留10月龄以上的种猪，这14天内不分娩，对所有种猪投予高剂量药物2周，如泰妙菌素6～8毫克/公斤体重，安全可靠地清除感染猪群中的猪肺炎支原体。
一个可行方法是早期隔离断奶。这个方法在北美及南美是非常普遍的，在亚洲某些国家也很盛行。此法已被很好地运用于有几千头母猪的大规模猪场，且必需是多点式饲养场。仔猪在受到感染母猪传染之前，于7～15日龄断奶。这些断奶仔猪饲养于特别设计的保育舍，之后再移动一次到育肥舍。断奶后用高剂量抗生素治疗至少2～3周。
清除之后，必须执行严格的生物防治计划，要完全封闭猪群。种群必须采购自安全无疾病来源的猪场，尽可能固定自同一个种猪场或至少相同种猪来源购买。新进后备猪必需隔离检疫8周，且在移入猪群前认真检查猪肺炎支原体。可于隔离检疫时将本场的阴性猪混入新进猪群以检测感染的情况，在隔离检疫结束前检查血液及肺脏。这个方法也有助于年轻后备母猪逐渐适应原有猪群的健康状况。
2、加强卫生管理：一般对猪群的卫生管理必须考虑下列事项：
⑴母猪群维持胎次多样化：较老母猪比新母猪的免疫力好，它们传递较佳的免疫力给其仔猪，且细菌污染低；
⑵要注意保温的控制、全进全出、清洁与消毒畜舍；
⑶避免过度拥挤，特别是在大型猪舍；
⑷控制温度、贼风、灰尘、氨气、二氧化碳；
⑸避免向不同来源购猪；
⑹避免应激、移动、混栏，特别是不同年龄间；
⑺适当提供饲料及饮水；
⑻要非常严格防治其它疾病：蓝耳病、伪狂犬、放线杆菌胸膜肺炎、猪流感、猪圆环病毒、猪呼吸道冠状病毒。如有必要，在适当时机使用疫苗或加药以对抗这些病原。
3、药物预防：有数种抗生素可以对抗猪炎支原体。支原体对大环内酯类、林可胺类敏感，特别是截短侧耳菌素枝原净（valnemulin）。四环素类与截短侧耳菌素间的协同作用提升了对支原体的效用，且扩展对抗革兰氏阴性菌的抗菌谱。猪肺炎支原体对泰妙菌素非常敏感。
在急性阶段可以用针剂治疗，但比较常用饲料或饮水加药。药物组方：80％枝原净125克＋金霉素300克＋扶本康（主要成份氟苯尼考）500克，添加到一吨饲料中，于支原体在母源抗体开始下降后开始增殖时投放。通常在断奶后或仔猪转群时，在饲料或饮水中加药1～2周来预防。在进入育肥舍前后，再加药1～2周预防。注意加药的时间与剂量对药效是很重要的，并且预防比治疗更有效。
4、疫苗与免疫：好的商品化支原体疫苗可减少经济损失、生长迟滞、死亡率、达到上市体重时间及降低支原体数。但必需知道他们并无法清除感染、防止支原体的寄生。
目前的疫苗可以只接种一次或隔3周后再加强一次。疫苗接种于仔猪，首免时间是很关键的。免疫必需于发生临床症状前实施，于5～7日龄，严重感染场在21～28日龄加强免疫一次，当猪群建立了免疫力，临床症状会延后出现于较大的猪。这时就绝对必须将接种首免的时间延后到6～8周龄，甚至更晚，在这样的状况下是较好的选择。每一个农场都需要个别的制定计划以达最好的保护。建立血清学检查数据有助于准确预估自然血清转阳发生时间，并选择最好的免疫时机。第一次注射疫苗5周后才会有免疫力。蓝耳病病毒的传染会干扰免疫，非常重要的是要在蓝耳病感染前接种猪肺炎支原体。
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