为了保证无公害生猪生产，必须做好粪尿处理及环境控制工作，做到对环境的零污染或者是最低污染。关于猪场环境控制和粪尿处理的文献很多，也主要集中在对猪场建设、饲料营养控制、粪尿处理等方面。本章综合这些观点，从循环型畜牧业建设角度提出“四化”的方法，即减量化、无害化、资源化、生态化。
生态化：即通过合理的布局，使养殖业与种植业、水产业、林业等密切联系，有机结合共同发展。目前，国内外常用的物质循环利用型生态系统主要有种植业―养殖业―沼气工程三结合的生态工程，养殖业一渔业―种植业三结合的生态工程、养殖业―渔业―林业三结合的生态工程等类型。其中种植业―养殖业―沼气工程三结合的物质循环利用型生态工程应用最为普遍，效果最好。
规模化猪场排出的粪便污水进入沼气池，经厌氧发酵产生沼气，供民用炊具、照明、采暖（如温室大棚等），甚至发电；沼液不仅作为优质饵料，用以喂鸡、喂猪、养鱼、养虾等，还可以用来浸种、浸根、浇花，并对作物、果蔬叶面、根部施肥；沼气渣可用作培养食用菌、蚯蚓，解决饲养畜禽蛋白质饲料不足的问题，剩余的废渣还可以返田增加肥力，改良土壤，防止土地板结，大大减少化肥、农药的用量。
可以看出，物质循环利用型生态系统实际上是一个以生猪养殖为中心，沼气工程为纽带，集种、养、鱼、副、加工业为一体的生态系统，它具有与传统养殖业不同的经营模式。在这个系统中，生猪得到科学的饲养，物质和能量获得充分的利用，环境得到良好的保护，因此生产成本低，产品质量优，资源利用率高，收到了经济效益与生态效益同步增长的效果。
规模化养殖业的粪、尿和农业化肥均是氮、磷污染的两大来源，据测算，一个年产5000头规模的养猪场，每年至少向周围排污1.5万吨，大约相当于向周围排放54吨氮和15吨磷。无疑是一个很大的排污量。如果实行农牧结合，养种结合，按一般的施肥量（10千克氮/亩）计算，只需167公顷农田（年种两茬），就能就地消化。如果种草、种菜收刈多次，需肥量成倍增加，消化量更大。如果规模小一点就更好解决。如若采用机械或其他处理方法则需增加很多投资。可见，农牧结合，适度规模经营结合千家万户化污为肥、回归自然，实现农业良性循环是一种经济、有效、适合国情，解决氮、磷污染之举。
另一种行之有效的办法是实行综合养殖，如猪―鱼，猪―气（沼气）―鱼等相结合。湘潭和全国许多地方利用猪粪繁殖浮游生物养鱼，或加工成复合肥与饲料，实行猪―气―加相结合，既有效地保护了环境，又增加了收入。
此外，猪粪通过微生物发酵，将粪中的氮素转化为微生物菌体蛋白，将难以吸收的复杂化合物变为易消化吸收的简单化合物作为饲料，进行再利用，亦可达到变废为宝的目的。
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