近年来，发酵床养猪技术的应用越来越广，但此技术在山东、浙江、福建等地推广的过程中，暴露出了一些问题。中日合资临沂益康公司经过长期的实践就解决这些问题提出一些建议。
猪粪不能发酵垫料我们发现，有的公司要求用猪粪发酵锯末、稻壳等垫料，实际上这是相当不安全的。因为发酵垫料的过程中只产生50℃左右的温度，不足以杀死所有有害菌。如果用的是病猪的猪粪，更会传染在发酵床上的正常猪。山东、浙江已经有客户遇到这样的问题了。
锯末使用有讲究最好不使用松木、桦木或者是含油的锯末，此类锯末使用效果差。
冬天做发酵床不能放大量的水我们经过长期的实践发现，在冬季做发酵床的时候，应以不放水或者少放水为好。在东北，有的客户发酵垫料时就放了很多水，造成了锯末垫料吸水性下降。等猪放上去后，猪粪很快就水饱和，使发酵床变臭，不能达到无臭味的目的。
正常防疫不能少有的客户认为利用发酵床技术养猪就可以不防疫、不预防性投药了，这是一种错误的想法。利用发酵床养猪，防疫还是要按正常程序做的，预防性的药物也可以用。同时，发酵床本身不能消毒，而猪舍外是要消毒的。
两批猪之间发酵床要重新发酵第一批猪出栏后，要放一些新鲜的锯末、米糠（或玉米粉）和发酵床专用菌种重新发酵后，再上下一批猪。
夏季重点防止热应激的发生在福建、浙江等地区，有个别公司过度强调通风对猪舍的降温作用，更有一些地方使用的垫料达到90厘米厚，造成了夏季有热死猪的情况发生。实际上，在我国南方地区，炎热的夏季高温、高湿，通风降温已经不能起到明显作用了（猪舍内外温度都会高达40℃以上），垫料如果过厚，两者的热量叠加，温度就更高了。所以，夏季在南方，一方面要封闭猪舍，用水帘或冷风机降温；另一方面要把垫料的厚度降到45厘米左右。我们指导的福建、浙江的几十家大型养猪场，用这种方法效果都很好的。
发酵床的发酵池千万不要下挖发酵池一旦下挖，夏季就有可能要渗水到发酵床的底部，造成发酵床的失败。要建设地面式发酵床。在中国最早做发酵床养猪、被誉为“中国懒汉养猪第一人”的山东农业大学李铁坚教授也同意这种观点。我在和他交流时，专门提到这个问题，得出“发酵床的发酵池不能下挖”的统一意见，除非是在新疆、甘肃、宁夏等特别干旱的地区。
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