（一）母猪
卵巢失调而引起母猪的不孕，最常见的是持久黄体，还有卵巢单侧或双的卵泡及黄体囊肿，使母猪的发情受到干扰。
卵巢囊肿通常有卵泡囊肿和黄体囊肿两种类型。
1.卵泡囊肿在母猪经常表现为双侧卵巢，卵泡直径大于排卵卵泡，直径为2-4厘米或更大，且这些卵泡已丧失排卵的潜力，囊肿的卵泡壁较薄，而且细胞膨胀受损，特别是细胞染色体已固缩退化，而卵泡细胞仍具有分泌雌激素的功能，血液中类固醇水平升高，母猪则表现为发情延长或间断或持续发情的现象。
2.卵巢黄体囊肿是指黄体化卵泡由几层黄体化细胞包裹着充满液体或血的腔，这就形成了一半卵泡一半黄体。黄体囊肿一般与乏情有关，但在很多情况下，两侧卵巢都有可能出现黄体或卵泡囊肿。这些囊肿是造成内分泌紊乱最经常的原因，特别是泌乳最多时概率更大，并且一般不会自愈，必须治疗。卵巢囊肿在一些近交系中出现较多，但卵巢囊肿往往也随年龄增加而加重，从而造成不育，这样的母猪应淘汰。
3．持久黄体往往表现为不发情。一般只能通过激素分析才能确定，而短发情周期可能是由于没有形成一个完全成熟的黄体。发育的黄体在发情的6天或7天就发生退化，使发情周期的时间仅为9―12天。这样的母猪即使是发情配种也会因孕酮分泌不足而导致胚胎早期死亡。如果出现持久黄体，并已确诊，可以用前列腺素F2α或其类似物处理，使黄体溶解引起母猪发情，再进行配种。
（二）公猪的不育
公猪在猪群中的数量虽少，但影响较大，特别是集约化饲养条件下，更应重视此问题。
1.阴茎的缺陷如阴茎偏向一侧，或射精的开口位置不正。这些公猪虽可以表现为正常的性行为，但往往因有关肌肉在插入时扭曲或由于阴茎位置不正不能插入，或插入后不能拔出，因此，不能正常射精，因而出现不育或低繁殖率的现象。有这类缺陷可以通过手术得到改善，但一般这类公猪应淘汰。
另一类情况是由于交配时阴茎受损而导致不育或繁殖力下降，如母猪交配时跌倒或扭转，造成公猪阴茎受伤，但不多见。
2．隐睾是指睾丸未降至阴囊，致使睾丸在体内高温下受损，细精管上皮受到破坏，造成无精症。这种损伤不可逆，隐睾有时是单侧也可是双侧。双测隐睾尽管公猪也表现性欲及完整的性行为链，但无精子产生。单侧隐睾虽可育但精液产量明显少，往往造成繁殖力较低。公猪隐睾如果外观不能确定可通过触摸进行检查。一般公猪隐睾发生率高于其他家畜，且多数为双侧，应引起注意，这样的公猪一旦发现应立刻淘汰。寒冷季节检查时应格外注意，因为此时公猪会提高睾丸位置。
(三)间性
是猪不育的重要原因之一。间性猪卵巢和睾丸可能是单侧，有时甚至可以发情排卵，还可以产生后代，但窝产仔很少。间性母猪可能有较小的阴道，突出的阴蒂，其发生率一般在1％-2%，有些还有阴囊发育，有些有明显獠牙，这样的猪应淘汰。有时一些公猪由于染色体异常，如多一个X染色单体，即性染铎体XXY型，多数情况，这样的猪无生育能力。染色体异常只能通过核型分析的方法确定。
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