肉种鸡的笼养，虽然节约垫料，提高了饲养密度，节省了饲料，而且还减少了种鸡生产中最容易发生的疾病感染和传播，但也存在着很多不足之处。由于肉种鸡本身体型大，在笼内饲养活动量少，从而造成体质下降，对疾病的抵抗力减弱，出现鸡只过肥、脂肪肝综合征、啄癖、神经质等不利因素。
一、过肥和脂肪肝综合征
这是笼养鸡经常性运动不足的后果。为提高产蛋种鸡群的产蛋率，不合理的饲喂高能量日粮，是引起该病的根本原因。其特征病变为肝脏肿大，肝呈黄色油腻状，表面有出血点和白色坏死灶，质脆易碎，用刀切时，在刀的表面有脂滴附着；突然死亡的鸡只肝包膜破裂，表面和腹腔内有血块；皮下、腹腔脏器表面、骨盆腔及输卵管周围均积有大量的脂肪。患此病的鸡普遍过肥，体重一般超出正常的25％～30％，产蛋率下降，死亡率增加。高温季节此病尤为明显。
预防鸡只过肥和脂肪肝综合征的有效方法是：严格执行育成期母鸡的限饲程序，以保持适当的标准体重；应注意保证日粮中足够的营养成分，对发病鸡群可在每100千克饲料中添加氯化胆碱50克、蛋氨酸50克、多种维生素5～10克，连续用10天；也可在每吨饲料中添加硫酸铜63克、胆碱550克、维生素Ｂ 33毫克、维生素Ｅ 5 500国际单位、ＤＬ?蛋氨酸550克，同时将日粮中粗蛋白提高1％～2％，能量水平适当降低，对发病鸡群有较好的疗效。
二、产蛋鸡疲劳症
在笼养产蛋鸡中，该病占有特殊位置。由于集约化饲养，体内无机盐的消耗明显增加，这是造成发生疲劳症的主要原因。其特征是：肌肉松弛，腿麻痹，骨质疏松脆弱。由于肌肉松弛，鸡翅膀下垂，腿麻痹，不能正常活动，出现脱水，消瘦而死亡。鸡群中有3％～5％的鸡出现临诊症状，这多出现在产蛋高峰期，往往是由于缺钙或钙、磷比例不当有关。产蛋高峰期，鸡产蛋时从鸡体内带走大量的钙，而从饲料中又不能满足这种消耗时，只能动用骨骼中的钙。因此，如果不注意钙的及时补给，鸡体就会受损，特别是最高产的母鸡受害最大，瘫鸡最多。
预防：①勤观察鸡群，发现有产软壳蛋的鸡或在笼内站立不起来的鸡，应立即挑出隔离饲养，并及时饲喂骨粉，能吃多少供应多少，一般经过3～5天就可治愈。②笼养高产肉种鸡的饲料含钙量不能低于3.5％，对于发病时间较长的鸡群可先增至4％。另外，当发现鸡群疲劳症病例较多时，可以用贝壳粉补钙，喂量为每100千克饲料添加1～2千克，连喂１周后，可以改为0.5～1千克的量喂给。
三、啄癖
这里高密度饲养特别是笼养条件下普遍存在的现象。雏鸡在脱换绒毛时出现啄羽囊、啄趾；育成鸡和成鸡啄尾羽、背羽；产蛋鸡啄蛋等。这些恶癖都是行为性的，所有鸡只都会遭受互啄。胆小的鸡只受欺负，受啄的程度较厉害；恐惧感越重的鸡，受啄越厉害。
为预防鸡的互啄癖，日粮中的各种营养成分比例要得当，饲养环境要改善，加强饲养管理。鸡群一旦有啄癖行为，要迅速查明原因，并努力加以消除。
四、过早换羽
笼养产蛋鸡经常有提早换羽的现象发生。光照增加过快或改变原有的光照计划，使光照时间缩短，日粮中含钙量过高，气温骤降，甲状腺机能亢进，断水断料等都会引起不应有的过早换羽。过早换羽可使产蛋率降低到30％～40％，因此要防止过早换羽，必须减少对鸡群的应激，每天钙的摄入量不宜超过4.2克，不断增加光照时间以刺激脑垂体，产蛋期间力争保持稳定的饲养环境。
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