鹿的配种与春它动物不同：一是发情集中在9月下旬到11月上旬，只有2-3个发情周情；二是鹿不让人接近；观察发情（发情鉴定）不如其它家畜方便；三是鹿的妊娠诊断技术尚不成熟。
1、配种准备：首先是将母鹿、仔鹿适时断乳分群。不论是一次性断乳分群，还是分批断乳分群，都应当在8月15日前结束，不然会影响母鹿发情或第二年产晚仔，造成恶性循环。其次做好母鹿营养调整。由母鹿经过哺乳期，膘情普遍下降，所以要尽量给母鹿营养丰富的青绿饲料，最好喂胡萝卜、大麦芽，使母鹿恢复到中上等膘情，即所谓配种体况。再次是调整鹿群。淘汰老弱残病鹿，将年轻、体壮、膘情中等偏上、后代好、符合选种方向母种鹿组成核心群，当然也要做好配种计划，落实人员，准备好配种记录，做好圈舍维修和消毒等工作。
2、要选种公鹿：一定要用最优秀的，也就是特级或1级种公鹿配种。好的种公鹿除体形好、膘情好和性欲之外主要是茸形好，茸要粗、大、嫩。四锯以上的花公鹿，三杈茸鲜重不低于3.5公斤；四锯以上马鹿四杈茸鲜重不低于7.5公斤。不少养鹿户用花三杈茸鲜重不足2公斤、马四杈茸鲜重不足4公斤的鹿作种公鹿配种，这样的鹿群茸产量肯定不会高，经济效益也肯定不会好。
3、要做好选配：要根据生产能力、亲缘关系、遗传力等科学地选择互相交配的公母鹿，防止退化和繁殖不理想后代。选配的简单做法是用最优秀的公鹿配核心群的母鹿。一般的母鹿也要用好公鹿配种。对于的缺欠的母鹿，如短腿、凹腰、狭胞等要采用异质选配的方法，以免母鹿的缺欠在后代中再现出来；现在个体养鹿户就十几、二十几只母鹿，公鹿质量不高，基本是胡交乱配，鹿崽是产了，但鹿茸肯定不会高产；应当改进。
4、配种方法：现在普遍实行单公群母或试情况配种的方法。过去的多公配多母方法由于谱系不清、鹿有伤亡等已不再采用。
单公群母法；就是用一只公鹿配15-18只母鹿。其中有一配到底和中间替换种公鹿两种形式。一配到底法优点是谱系清楚，只要公鹿性欲好，精液品质好，受胎率在95%以上。有些鹿场采取5-7天换1次种公鹿的方法，优点是公鹿可得到休息，不足是后代系谱不太清楚，并且太麻烦，换下的公鹿需单圈饲养，也不方便。单公群母法要注意观察，发现公鹿配种能力弱，要立即更换。2）试情配种。就是用一只试情公鹿每天早5时至晚4时放在母鹿群肉试情，有接受爬跨的母鹿就是发情，将其拨到种鹿圈内配种，每次至没能发情母鹿时结束。优点：一是谱系清楚，二是可提高种公鹿利用率，平时一只种公鹿能配15-18只母鹿，试情配种能配30-40只，配种率可提高一倍。缺点是麻烦。试情公鹿可在生产群选择年轻体壮、性欲旺盛的公鹿。试情方法：一是把试情公鹿放在母鹿群内。严加看管，发现爬跨马上将母鹿拨出；二是用输精管结扎的公鹿试情；三是用戴试情布的公鹿试情；四是用阴茎移位的公鹿试情。
配种于11月15日结束，将公母鹿分开。拨出的种公鹿应单独组群，加强看管和饲养，防止互相争斗。公母鹿最好分开饲养，因公鹿母鹿饲料、饲养管理有所不同，养在一起对公母鹿都不利，而且有漏配的母鹿会发情受孕，容易产晚崽或在9、10月份产仔，仔鹿很难成活。
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