蜥蜴是变温动物，在温带及寒带生活的蜥蜴于冬季进入休眠状态，表现出季节活动的变化。在热带生活的蜥蜴，由于气候温暖，可终年进行活动。但在特别炎热和干燥的地方，也有夏眠的现象，以度过高温干燥和食物缺乏的恶劣环境。可分为白昼活动、夜晚活动与晨昏活动三种类型。不同活动类型的形成，主要取决于食物对象的活动习性及其他一些因素。
个体蜥蜴的活动范围很局限。树栖蜥蜴往往只在几株树之间活动。据研究过的几种地面活动的蜥蜴，如多线南蜥等，活动范围平均在1，000平方米左右。有的种类还表现出年龄的差异。刚孵出的伍蜓（Sphenomorplus）多在孵化地水域附近活动，成年后才转移到较远的林中活动。
大多数蜥蜴吃动物性食物，主要是各种昆虫。壁虎类（Gekkonids）夜晚活动，以鳞翅目等昆虫为食物。体型较大的蜥蜴如大壁虎（蛤蚧，Gekkogecko）也可以小鸟，其他蜥蜴为食物。巨蜥（Varanus）则可吃鱼、蛙甚至捕食小型哺乳动物。也有一部分蜥蜴如鬣蜥（Agama）以植物性食物为主。由于大多数种类捕吃大量昆虫，蜥蜴在控制害虫方面所起的作用是不可低估的。很多人以为蜥蜴是有毒动物，这是不对的。全世界6000种蜥蜴中，已知只有两种有毒毒蜥，隶属于毒蜥科（Helodermatidae），且都分布在北美及中美洲。
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