春寒料峭、咋暖还寒，加上易遭受阴冷天气，使春茬黄瓜在栽培过程中经常出现黄瓜幼苗茎基部或嫁接口处腐烂、流胶的现象，造成黄瓜缺苗断垄。其发生主要受低温弱光高湿影响后，植株体内充水，遭受病菌侵染。其主要被害症状是茎基部水渍状，表皮完好，内部腐烂，维管束不变色，在茎裂口处有胶状物流出。多发生于嫁接口以上黄瓜子叶下部。侵染病害主要有疫病、蔓枯病等，并伴随细菌性病害混合发生。其防治措施如下：
防止低温危害：保证嫁接后及幼苗期最低气温不低于13℃，昼夜温差在15℃左右；定植时地温不低于15℃。这样基本可预防嫁接黄瓜茎基腐病的发生。
药剂灌根：在苗期和定植缓苗后用恶霉灵等加生根剂灌根防病。
及时用药控制病害：病害发生后要及时选用内吸性、真菌和细菌均能防治的农药复配剂进行防治。有效配方有：农用链霉素或中生菌素加霜霉威或甲霜灵重点喷病茎部，3～4天一次，连喷2次可基本治愈；此外用100倍0.15%四霉素涂茎效果也很好。