根蛆又叫地蛆、蒜蛆，常见的是种蝇和葱蝇的幼虫，危害盛期在秋季和下年春季。蒜蛆在秋季即可危害蒜苗，以幼虫蛀食大蒜鳞茎，引起鳞茎腐烂，地上部叶片表现枯黄、萎蔫，甚至死亡。

防治大蒜根蛆，可结合播种每亩用5%辛硫磷颗粒剂3~4公斤拌饼肥或细土50公斤，撒施于播种沟内。选出健康无病的种蒜进行药剂拌种处理，即每50公斤用80%敌百虫20倍液5公斤拌种，或用50%辛硫磷乳油100~150毫升加水25~30公斤，拌种蒜200~250公斤，随拌随播。幼虫发生初期，将2.5%敌百虫粉剂撒在植株基部及其周围土壤中。也可以选用90%敌百虫800~1000倍液、除虫菊酯400倍液、硫酸亚铁300~400倍液、48%乐斯本乳油1000倍液灌根防治。将喷雾器喷头上的旋水片取出，把药液注入根部土壤中，10天一次，视虫情防治2~3次。在成虫盛发期，及时喷药防治。每亩用2.5%敌百虫粉剂1.5~2公斤，或者选用40%乐果乳油1000倍液、2.5%溴氢菊酯乳油2000~3000倍液灌根，每隔7天一次，连续防治2~3次，以上午9~11时施药效果最好。