生理性病害无传染性，亦称非传染性病害。多由营养物质和水分的过多或过少，温度过高或过低，日光过强或过弱，以及土壤通气不良或空气中存在有毒气体等周围环境因素；或种子本身质量；或种子遗传基因发生变异引起，使幼苗表现不正常。此类病害虽无传染性，但在同一条件下常成片发生，并能诱发和加重传染性病害的发生和为害程度，造成一定损失。
1 “烧根”
1.1 识别与为害
受害轻或病害初起，根先端黄褐色水浸状，严重者根及幼茎基部水浸状黄褐至栗褐色腐烂。病苗易拔起，子叶较正常苗略小而厚，暗绿色，有时子叶边缘或先端出现黄褐色干枯坏死，受害后生长缓慢或死亡。在发病苗床中往往发生普遍或点片发生较重，常需重播。
1.2 病因
“烧根”亦称肥害。由营养土中使用未腐熟的有机肥，有机肥继续发酵而伤根；或肥料施用不均、或施用过量，使土壤中肥料溶液浓度始终保持较高，产生负向渗透压，导致根系不能正常吸收土壤中的水分而引起。
1.3 防治方法
①使用充分腐熟的有机肥配制营养土；用肥适量并充分拌匀。
②肥害发生时，及时适量洒水，以降低肥料溶液浓度，尽可能减轻受害程度。
2 沤根
2.1 识别与为害
是低温季节黄瓜育苗期间的常见病。病苗易拔起，无白根，根锈褐色水浸状直至腐烂。地上部萎蔫，叶色转淡呈黄绿色或乳黄色，自叶缘开始焦枯。病苗生长极为缓慢，严重时成片萎蔫、死亡，造成局部毁苗。
2.2 病因
由较长时间的低温和高湿引起，即土温较长时间持续低于12℃，又遇洒水过量或连阴雨天气，致使根部处于低温、过湿和缺氧状态，其代谢与吸收能力降低，不能正常生长，导致根部坏死变褐。
2.3 防治方法
①床土疏松、肥沃，床面平整，以利根系生长及洒水时受水均匀。
②加强苗床温湿度管理，适当进行通风、透光，锻炼幼苗，避免苗床土温过低过湿。
③采用电热线育苗，床土温度控制在16℃左右，一般不宜低于12℃。
④播前浇足底水，整个育苗过程适当控水，需要时洒水适量；备好干细土，在床土湿度大时，可撒于床面降湿。
3 徒长
3.1 识别与为害
徒长苗茎细而长，节间间距大，叶色淡，叶片薄，组织柔嫩，根系衰弱。其抗逆性差，易受冻、易发生日灼及猝倒病等；因营养不良致花芽分化期延迟，花芽数量少、易落花，造成早熟性差且产量低。
3.2 病因
主要原因是由光照不足、温度偏高、湿度过大引起。昼夜温差小，播种过密，通风不良，氮肥过多等也能导致幼苗徒长。刚出土幼苗的下胚轴对温度很敏感，管理不当，常造成徒长。
3.3 防治方法
①合理配制营养土，避免掺人尿素等速效氮肥，即使使用也要适当。
②选用透光性好的塑料薄膜，加强苗床温湿度管理，及时正确进行通风、透光。
③幼苗出土后控制好夜间床温，使前半夜为15～20℃，后半夜10～15℃，早晨不低于5℃，保持一定的昼夜温差，预防幼苗下胚轴生长过快。
④播种不密不稀，防止大苗相互拥挤引起徒长。
4 低温障碍及冻害
低温障碍和冻害是冬春黄瓜育苗期间经常出现的生产问题。管理不当或遇长期雨雪、低温天气易于发生，严重时往往需重播，明显影响生产。
4.1识别与为害
受害轻或较轻，子叶先端、边缘或部分子叶褪绿，呈黄至白色。重时可导致部分子叶或部分真叶萎蔫干枯甚至死亡。冻害发生时，子叶边缘（叶背尤明显）或真叶上出现水浸现象，甚至幼苗水浸状萎蔫倒伏，最后呈干枯死亡。长时间持续低温往往造成不发新根，生长缓慢，可导致弱寄生物侵染，甚至成片死亡。
4.2 病因
黄瓜耐寒力弱，0～10℃就会受害，低于3～5℃生理机能出现障碍造成伤害。当温度降到黄瓜幼苗能忍受的低温界限以下时，依低温程度和时间长短不同，引起生理障碍的程度也不相同，从而表现出多种受害症状。
4.3 防治方法
①加强苗床管理与保温措施，推广电热线育苗，适时通风透光并谨防冷风侵入。
②育苗期间密切关注天气预报，特别对突然来临的寒流做好预防准备，备好覆盖物，以防受害。
③做好定植前炼苗，提高幼苗的适应性与抗逆性。
④受冻后，特别要注意使苗床的温度缓慢上升，日出后用草帘适当遮荫，使黄瓜生理机能慢慢恢复，不可猛见阳光，尽量减少损失。
5 出苗不齐
5.1 识别
播种后有些种子长时间不出苗，导致苗床缺株；或出苗时间长，造成瓜苗大小不一的现象均称为出苗不齐。
5.2 原因
种子未经催芽即播种，施用未腐熟的有机肥或化肥使用过量，播后即遇长期雨雪、低温天气致使床温偏低，床土水分过高（造成烂种）或过低（影响对水分的吸收）等，以及种子本身质量问题（如陈籽、种子成熟度不高和瘪籽）等多种因素都能造成出苗不齐。
5.3 防治方法
针对不同病因，采取相应措施预防（部分措施可参见以上相关部分）。
6 黄（白）化苗
6.1 识别与为害
育苗中仅偶尔出现，对生产无影响。出土后病苗始终保持黄（白）色，因光合作用严重受阻或根本不能进行光合作用，故幼苗生长缓慢，最后萎蔫死亡。
6.2 病因
主要是遗传基因发生变异，幼苗不能进行正常的生理活动。
6.3 防治方法
不需进行针对性防治，在进行苗床管理时拔除病苗即可。
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